Kutatási témák

  1. Túlélési elemzés vizsgálata daganatos betegségekben. Fő célunk olyan eszközök fejlesztése, amelyek a tumoros beteg túlélését, a daganat terápiás válaszát és mutációit génexpresszió-alapú mono- vagy multigénes prognosztikai és prediktív mintázathoz kapcsolják. Részt veszünk az azonosított prognosztikai és prediktív markerek validálását célzó nemzetközi együttműködésekben.
  2. Bioinformatikai adatelemzés. Egyszerű statisztikai háttérrel rendelkező eszközöket fejlesztünk a tumoros megbetegedésekkel kapcsolatos adathalmazok automatizált elemzéséhez. Eszközeink között adatbázis-alapú és statisztikai platformok egyaránt szerepelnek. Emellett statisztikai elemzést is biztosítunk együttműködő partnereink számára.

Hazai kollaborációk

  • HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont
  • HUN-REN Szerves Kémiai Intézet, Budapest
  • Semmelweis Egyetem, Budapest

Nemzetközi kollaborációk

  • University of South Carolina, USA
  • John Hopkins, Baltimore, USA
  • Yale Cancer Center, New Haven, USA
  • Stanford University, USA
  • University of Michigan, USA
  • Charité Berlin, Germany
  • University of Frankfurt, Germany
  • ICREA, Spain
  • Imperial College, London, UK
  • University of Manchester, UK
  • Imperial College, London, UK
  • Medical University of Vienna, Austria
  • University of Lyon, France
  • Okayama University, Japan
  • Peking University, China

Saját honlap

http://gyorffy.semmelweis.hu

Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=KUKTJFYAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

ELIXIR Magyarország

Az ELIXIR egy európai kutatási hálózat, amely összefogja a bioinformatikával foglalkozó egyetemeket, oktatókat, kutatókat.

A magyar csomópontot az HUN-REN TTK vezeti, a csomópont vezetője Dr. Győrffy Balázs.

Az ELIXIR Magyarország honlapja a www.bioinformatics.hu címen érhető el.

Vezető

NévTelefonszámCsoportIroda
Dr. Győrffy Balázs+361-382-6722Onkológiai Biomarker KutatócsoportD3.11A

 Munkatársak

NévTelefonszámCsoportIroda
Dr. Menyhart Otília+361-382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportD3.05B
Dr. Munkácsy Gyöngyi+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportD3.05B
Dr. Fekete János+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportD3.05B
Ankita Murmu+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportÉ3.10A
Kovács Szonja Anna+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportÉ3.10A
Makovsky Zsuzsa+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportÉ3.10A
Dobolyi Zsófia+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportÉ3.10A
György Dorka+361/382-6745Onkológiai Biomarker KutatócsoportÉ3.10A

Publikációk

Kovács S.A., Győrffy B. Transcriptomic datasets of cancer patients treated with immune-checkpoint inhibitors: a systematic review. J Transl Med 2022;20:249 doi: 10.1186/s12967-022-03409-4

Müller D., Győrffy B. DNA methylation-based diagnostic, prognostic, and predictive biomarkers in colorectal cancer, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Reviews on Cancer 2022;1877(3):188722 doi: 10.1016/j.bbcan.2022.188722

Lánczky A., Győrffy B. Web-Based survival analysis tool tailored for medical research (KMplot): development and implementation, J Med Internet Res 2021;23(7):e27633 doi: 10.2196/27633

Menyhart O., Weltz B., Győrffy B. MultipleTesting.com: A tool for life science researchers for multiple hypothesis testing correction, PLoS ONE 2021;16(6): e0245824 doi: 10.1371/journal.pone.0245824

Bartha Á., Győrffy B. TNMplot.com: A Web Tool for the Comparison of Gene Expression in Normal, Tumor and Metastatic Tissues. International Journal of Molecular Sciences 2021;22(5): 2622 doi: 10.3390/ijms22052622