Kedvezményezett neve:

Természettudományi Kutatóközpont

A projekt címe: VEKOP-2.3.3-15-2016-00011

                              Molekulatárak és farmakológiai célfehérjék kölcsönhatásainak vizsgálata

A támogatás összege: 212 000 000 Ft

A támogatás mértéke: 100%

Tartalmi összefoglaló:

A pályázat során kimondottan a kismolekulák és fehérjék kölcsönhatásának detektálására és kvantitatív mérésére fejlesztett nagy-érzékenységű készüléket szereztünk be, ami kiegészült molekulakönyvtár kezeléshez szükséges két további műszerrel (HPLC/MS és liofilizátor készülék). A eszközbeszerzésben tervezett műszereket beüzemeltük, a sikeres tesztüzemek lezajlása után a készülékeket használatba vettük. A létrehozott molekulatár vegyületeit a HPLC/MS készülék segítségével ellenőriztük, kémiai integritás és tisztaság szempontjából  vizsgáltuk. A liofilzált formában tárolt vegyületeket feloldás után fehérje-kismolekula kölcsönhatások mérésére használtuk. Meghatároztuk például több kismolekula kötődésének egyensúlyi állandóját ITC illetve SPR segítségével, továbbá vizsgáltuk a kötődés kinetikai aspektusait. A műszerpark segítségével létrejött egy olyan infrastruktúra, melyet például fehérje-kináz inhibitorok fejlesztéséhez használunk (pl kötődési affinitás illetve tartózkodási idő növelésére célzott szerkezet-funkció vizsgálatokban) illetve mérhetjük az intézetben előállított kismolekulák biokémiai hatását fehérjék aktivitására is. Az ITC és SPR készülékek egy  további alkalmazása a fehérje-kismolekula komplexekek mellett a fehérje-peptid illetve a fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálata terén valósult meg.

A projekt időtartama:

2017.01.01-2020.12.28.

Koordinátor: dr Reményi Attila

Eszközbeszerzés

LC-MS készülék

SPR-ITC fehérje-kismolekula kölcsönhatás mérőállomás

Komplett liofilizáló rendszer

Publikációk:

Characterization of the Intramolecular Interactions and Regulatory Mechanisms of the Scaffold

Merő B, Koprivanacz K, Cserkaszky A, Radnai L, Vas V, Kudlik G, Gógl G, Sok P,Póti ÁL, Szeder B, Nyitray L, Reményi A, Geiszt M, Buday L. Protein Tks4. Int J Mol Sci. 2021 Jul 28;22(15):8103. doi: 10.3390/ijms22158103.

Peptide Based Inhibitors of Protein Binding to the Mitogen-Activated Protein Kinase Docking Groove.

Alexa A, Ember O, Szabó I, Mo’ath Y, Póti ÁL, Reményi A, Bánóczi Z. Front Mol Biosci. 2021 Jul 1;8:690429. doi: 10.3389/fmolb.2021.690429.

Co-regulation of the transcription controlling ATF2 phosphoswitch by JNK and p38.

Kirsch K, Zeke A, Tőke O, Sok P, Sethi A, Sebő A, Kumar GS, Egri P, Póti ÁL, Gooley P, Peti W, Bento I, Alexa A, Reményi A. Nat Commun. 2020 Nov 13;11(1):5769. doi: 10.1038/s41467-020-19582-3.

High-throughput competitive fluorescence polarization assay reveals functional redundancy in the S100 protein family.

Simon MA, Ecsédi P, Kovács GM, Póti ÁL, Reményi A, Kardos J, Gógl G, Nyitray L. FEBS J. 2020 Jul;287(13):2834-2846. doi: 10.1111/febs.15175.

MAP Kinase-Mediated Activation of RSK1 and MK2 Substrate Kinases.

Sok P, Gógl G, Kumar GS, Alexa A, Singh N, Kirsch K, Sebő A, Drahos L, Gáspári Z, Peti W, Reményi A. Structure. 2020 Oct 6;28(10):1101-1113.e5. doi: 10.1016/j.str.2020.06.007.

Dynamic control of RSK complexes by phosphoswitch-based regulation.

Gógl G, Biri-Kovács B, Póti ÁL, Vadászi H, Szeder B, Bodor A, Schlosser G, Ács A, Turiák L, Buday L, Alexa A, Nyitray L, Reményi A. FEBS J. 2018 Jan;285(1):46-71. doi: 10.1111/febs.14311.

Tracking down protein-protein interactions via a FRET-system using site-specific thiol-labeling.

Söveges B, Imre T, Póti ÁL, Sok P, Kele Z, Alexa A, Kele P, Németh K. Org Biomol Chem. 2018 Aug 15;16(32):5756-5763. doi: 10.1039/c8ob00742j.