Kutatási témák
- Túlélési elemzés vizsgálata daganatos betegségekben. Fő célunk olyan eszközök fejlesztése, amelyek a tumoros beteg túlélését, a daganat terápiás válaszát és mutációit génexpresszió-alapú mono- vagy multigénes prognosztikai és prediktív mintázathoz kapcsolják. Részt veszünk az azonosított prognosztikai és prediktív markerek validálását célzó nemzetközi együttműködésekben.
- Bioinformatikai adatelemzés. Egyszerű statisztikai háttérrel rendelkező eszközöket fejlesztünk a tumoros megbetegedésekkel kapcsolatos adathalmazok automatizált elemzéséhez. Eszközeink között adatbázis-alapú és statisztikai platformok egyaránt szerepelnek. Emellett statisztikai elemzést is biztosítunk együttműködő partnereink számára.
Hazai kollaborációk
- HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont
- HUN-REN Szerves Kémiai Intézet, Budapest
- Semmelweis Egyetem, Budapest
Nemzetközi kollaborációk
- University of South Carolina, USA
- John Hopkins, Baltimore, USA
- Yale Cancer Center, New Haven, USA
- Stanford University, USA
- University of Michigan, USA
- Charité Berlin, Germany
- University of Frankfurt, Germany
- ICREA, Spain
- Imperial College, London, UK
- University of Manchester, UK
- Imperial College, London, UK
- Medical University of Vienna, Austria
- University of Lyon, France
- Okayama University, Japan
- Peking University, China
Saját honlap
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=KUKTJFYAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ELIXIR Magyarország
Az ELIXIR egy európai kutatási hálózat, amely összefogja a bioinformatikával foglalkozó egyetemeket, oktatókat, kutatókat.
A magyar csomópontot az HUN-REN TTK vezeti, a csomópont vezetője Dr. Győrffy Balázs.
Az ELIXIR Magyarország honlapja a www.bioinformatics.hu címen érhető el.
Vezető
Név | Telefonszám | Csoport | Iroda |
Dr. Győrffy Balázs | +361-382-6722 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | D3.11A |
Munkatársak
Név | Telefonszám | Csoport | Iroda |
Dr. Menyhart Otília | +361-382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | D3.05B |
Dr. Munkácsy Gyöngyi | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | D3.05B |
Dr. Fekete János | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | D3.05B |
Ankita Murmu | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | É3.10A |
Kovács Szonja Anna | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | É3.10A |
Makovsky Zsuzsa | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | É3.10A |
Dobolyi Zsófia | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | É3.10A |
György Dorka | +361/382-6745 | Onkológiai Biomarker Kutatócsoport | É3.10A |
Publikációk
Kovács S.A., Győrffy B. Transcriptomic datasets of cancer patients treated with immune-checkpoint inhibitors: a systematic review. J Transl Med 2022;20:249 doi: 10.1186/s12967-022-03409-4
Müller D., Győrffy B. DNA methylation-based diagnostic, prognostic, and predictive biomarkers in colorectal cancer, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Reviews on Cancer 2022;1877(3):188722 doi: 10.1016/j.bbcan.2022.188722
Lánczky A., Győrffy B. Web-Based survival analysis tool tailored for medical research (KMplot): development and implementation, J Med Internet Res 2021;23(7):e27633 doi: 10.2196/27633
Menyhart O., Weltz B., Győrffy B. MultipleTesting.com: A tool for life science researchers for multiple hypothesis testing correction, PLoS ONE 2021;16(6): e0245824 doi: 10.1371/journal.pone.0245824
Bartha Á., Győrffy B. TNMplot.com: A Web Tool for the Comparison of Gene Expression in Normal, Tumor and Metastatic Tissues. International Journal of Molecular Sciences 2021;22(5): 2622 doi: 10.3390/ijms22052622